種皮和果皮的區(qū)別在于，種皮是覆蓋在種子周圍的皮，果皮是指果實外殼和外皮。其次種皮隨種子發(fā)育而改變，而果皮隨子房壁的組織而改變。種皮是包裹在種子外面，為了保護種子。果皮有著保護種子，固定果實和給果實上色的作用。

種皮與果皮首先的區(qū)別是性質不同，種皮是指被覆蓋在種子周圍的皮，果皮是指果實外殼和外皮。其次是形式不同，種皮隨著種子的成熟而不同程度的變化，而果皮由子房壁的組織分化、發(fā)育而成的果實部分。

再就是組成不同，裸子植物和被子植物合瓣花類是由一層構成的，離瓣花類和單子葉植物是由二層構成的。由二層構成的種皮，特分為內種皮和外種皮。而成熟的果皮，一般可以分為外果皮、中果皮、內果皮三層。

種皮是包裹在種子最外面的一層組織，具有保護種胚和萌發(fā)時吸收水分的作用。而果皮外中內三層的作用各不相同，內果皮在最里面一層，有的硬質化，由多層石細胞構成，起到與種皮一樣的作用，保護種子。

其中果皮，內維管束較多，呈網(wǎng)狀分布，如柑桔，果實成熟后即為桔絡，起著為果實吸收水分和固定的作用。外果皮的薄壁細胞多含葉綠體，成熟時，轉為有色體，致使果實有不同的顏色。